Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB6P18564 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGB6P18564 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms