Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRAP18433 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRAP18433 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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