Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms