Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT13P13646 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT13P13646 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms