Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms