Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFTRP13569 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFTRP13569 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFTRP13569 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFTRP13569 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms