Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BMP3P12645 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms