Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLBP1P12271 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms