Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms