Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI1P08151 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI1P08151 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI1P08151 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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