Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms