Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APODP05090 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APODP05090 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms