Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms