Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZBED1O96006 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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