Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1AO95602 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 689.9 ms