Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX6O95503 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX6O95503 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX6O95503 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms