Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEP104O60308 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms