Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALUO43852 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALUO43852 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms