Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD1B0YJ81 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms