Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms