Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms