Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms