Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DNAJB11Q9UBS4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms