Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms