Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms