Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms