Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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