Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms