Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRIM4Q9C037 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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