Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HDAC8Q9BY41 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDAC8Q9BY41 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDAC8Q9BY41 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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