Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms