Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP2Q9BX26 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms