Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms