Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB2BQ9BVA1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms