Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms