Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms