Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTV1Q96GA3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms