Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP3Q96DZ5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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