Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms