Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ULK4Q96C45 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms