Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN23Q96B33 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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