Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SHC3Q92529 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SHC3Q92529 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SHC3Q92529 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SHC3Q92529 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHC3Q92529 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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