Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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