Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APLFQ8IW19 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms