Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms