Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms