Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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