Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms