Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms