Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RPL39P5Q59GN2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms